科學(xué)家呼吁：第一時(shí)間共享新型冠狀病毒基因組序列

記者今天從中國(guó)科學(xué)院北京基因組研究所國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心獲悉，1月26日，國(guó)家生物信息中心/國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心收錄由中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院病原生物學(xué)研究所提供的5株2019新型冠狀病毒全基因組序列。

這是自2019年12月該病爆發(fā)以來(lái)，國(guó)內(nèi)公共數(shù)據(jù)平臺(tái)首次公開(kāi)發(fā)布數(shù)據(jù)。

據(jù)國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心主任鮑一明介紹，從2020年1月以來(lái)，陸續(xù)有30余株2019新型冠狀病毒的基因組序列被國(guó)內(nèi)外科學(xué)家破譯，絕大部分?jǐn)?shù)據(jù)都遞交到由德國(guó)建立的全球流感序列數(shù)據(jù)庫(kù)(GISAID)系統(tǒng)。

從該數(shù)據(jù)庫(kù)系統(tǒng)獲取數(shù)據(jù)需要注冊(cè)賬號(hào)并經(jīng)過(guò)審核，獲得權(quán)限的研究人員才可登錄系統(tǒng)瀏覽數(shù)據(jù)，并且只能單個(gè)下載基因組序列。這就造成了中國(guó)產(chǎn)生的數(shù)據(jù)需要先出口再入口的使用模式和現(xiàn)象，而且數(shù)據(jù)下載十分繁瑣費(fèi)時(shí)。

2020年1月22日，我國(guó)搭建的新型冠狀病毒信息庫(kù)(https://bigd.big.ac.cn/ncov)正式上線。

國(guó)家生物信息中心/國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心一直致力于構(gòu)建國(guó)家級(jí)組學(xué)數(shù)據(jù)存儲(chǔ)與共享公共平臺(tái)，力爭(zhēng)第一時(shí)間為國(guó)內(nèi)乃至全球科學(xué)家提供基因組數(shù)據(jù)的存管用服務(wù)。此次疫情爆發(fā)后，新型冠狀病毒信息庫(kù)上線，保持該病毒基因組數(shù)據(jù)發(fā)布動(dòng)態(tài)，持續(xù)為國(guó)內(nèi)外科研人員提供方便快捷的數(shù)據(jù)檢索及下載資源。

此次發(fā)布的5株2019新型冠狀病毒基因組序列的序列號(hào)為GWHABKF00000000、

GWHABKG00000000、

GWHABKH00000000、

GWHABKI00000000、

GWHABKJ00000000，

相關(guān)項(xiàng)目編號(hào)為PRJCA002165。

以上序列可在國(guó)家生物信息中心/國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心的項(xiàng)目庫(kù)或者冠狀病毒序列庫(kù)檢索并下載，無(wú)需注冊(cè)或向數(shù)據(jù)遞交者申請(qǐng)。

鮑一明告訴中青報(bào)·中青網(wǎng)記者，“我們呼吁全國(guó)的科研衛(wèi)生機(jī)構(gòu)在第一時(shí)間把2019新型冠狀病毒基因組序列遞交到國(guó)家生物信息中心/國(guó)家基因組科學(xué)數(shù)據(jù)中心存儲(chǔ)共享，為該病毒的科研和防控提供數(shù)據(jù)支撐。”