“技術宅”用基因測序來監(jiān)控新冠病毒是否變異

2月2日晚8時，南京鬧市區(qū)的江蘇路，行人寥落，車輛稀疏。但坐落在此的江蘇省疾病預防控制中心(以下簡稱江蘇省疾控中心)燈火通明，4樓的病原微生物實驗室里腳步匆匆、熱鬧不已。

“今晚的檢測報告大約多久能出來?”

“大概9點半到10點。”

“一會還有一批樣本馬上到。”

實驗室內(nèi)外，大家傳遞著有關檢驗的最新消息。

疫情發(fā)生以來，江蘇省13個設區(qū)市疑似新冠病毒肺炎的初篩陽性標本，都會送到這里復核確證。實驗室內(nèi)，檢驗人員受理著病毒樣品，提取核酸、加樣，上機檢測，基因測序。

核酸提取，直接接觸病毒，是整個實驗流程中最危險的一環(huán)。江蘇省疾控中心急性傳染病防制所副主任技師田華，在密閉的負壓生物安全二級實驗室，身著隔離衣、防護服，戴著N99口罩、護目鏡，套著鞋套，靴套和兩層醫(yī)用乳膠手套，從接收的各設區(qū)市新冠病毒咽拭子標本里提取病毒RNA。

“在里面連續(xù)做了3個多小時的實驗，頭暈得要命。”實驗結束后，田華終于卸下一身疲憊。她告訴科技日報記者，因為新冠病毒傳染性高，所以每一步操作都小心翼翼、精神高度緊張，剛才才做了一個多小時，就有點暈厥的感覺。“我告訴自己，扛住扛住，把這批做完就出來了，拼了。否則出去再進來，一來耗費醫(yī)療物資，二來增加感染風險，三來同事還等著出具核酸檢測報告。”

如今，檢驗人員每天3班24小時輪班，他們在負壓實驗室一“憋”就是三四個小時。在進實驗室前都不敢喝水，吃東西。從拿到樣本到出具檢測報告，時間約為6小時左右。

1月10日，中國公布新冠病毒全基因組序列。但隨著疫情不斷發(fā)展，病毒是否會變異得讓人類捉摸不透，如何監(jiān)控基因變異?

高通量基因測序技術，是江蘇省疾控中心應對新冠病毒的殺手锏，“高通量測序可以協(xié)助溯源病毒、監(jiān)控病毒變異趨勢、掌握病毒的發(fā)展方向，也可以為藥物研發(fā)提供參考。”該中心病原微生物研究所所長崔侖標說，借助該技術，2013年他們曾檢出H7N9和H3N2兩種亞型的流感病毒可以同時感染人。2016年檢出一種新型環(huán)狀病毒。

該中心病原微生物研究所技師趙康辰，正向裝有病毒核酸的試劑管中添加反應酶。“同事做好核酸提取后，我會用反應酶將核酸片段化，再加入磁珠，吸附病毒的核酸，去除人基因組、試劑殘留物等雜質(zhì)。經(jīng)過吸附、清洗，再將磁珠上的病毒核酸洗脫下來，加上分子標簽，連接到測序儀上，檢測病毒核酸序列。”趙康辰說，一套完整的病毒基因測序流程，36—48小時即可完成。

目前，江蘇省疾控中心已經(jīng)做了十多例新冠病毒的高通量測序。“我們也會挑選一些重癥病例和輕癥病例做基因組的比較，看看兩類人群攜帶的病毒基因是否有差異，目前，江蘇所有的新冠病毒基因序列，與國家公布的病毒全基因組序列高度一致。”崔侖標說。

行走在病原微生物實驗室，擦肩而過的多是80后、90后。1月20日以來，他們已經(jīng)連續(xù)工作近半月，有的退了回家過年的車票留在南京，有的甚至住在辦公室。

從除夕到初三，趙康辰一直在實驗室沒回家，瞌睡了就趴下打個盹。該中心病原微生物研究所副主任醫(yī)師吳濤、陳銀、朱小娟等人春節(jié)期間留守南京，與家人分隔兩地。

崔侖標是揚州人，今年過年，他和身為醫(yī)生的妻子都默契地選擇留在南京。“國家養(yǎng)兵千日用兵一時，現(xiàn)在到我們亮劍出手的時候了。”

這個兩個孩子的爸爸，已經(jīng)十多天沒有跟兒子們說話了。每天深夜到家，兒子們已經(jīng)睡去，上班時，兒子們還在熟睡。

但“戰(zhàn)斗”著的崔侖標并不孤單。前幾天晚10點，他突然接到一個外賣小哥的電話，下樓一看，不知是哪位熱心人士送來的鴨血粉絲湯和熱乎乎的卷餅。“你們真不容易。”小哥的一句話，讓崔侖標暖心到現(xiàn)在。

“崔博(士)快來，我們一起拍一張合影，20：20啦。”當時鐘指向20：20，崔侖標被實驗室外的年輕同事們招呼著，2020年2月2日20時20分就這樣定格在他們的人生中。